Добро пожаловать в класс превосходства

В центре сюжета учащиеся школы в Токио, основанной японским правительством для обучения молодых людей, которые в будущем станут институциональной опорой страны. Методика преподавания в этой школе нетрадиционна, так как учащиеся проживают в ней отдельно от остального общества и посредством учебы и своего поведения обеспечивают себя сами, используя квалификационные баллы в качестве денег. Класс делится на четыре категории (A, B, C и D), в которых A — это тот, у кого самый высокий уровень интеллекта и навыков, а D — тот, у кого наименьшее количество атрибутов. Основное внимание уделяется Киётаке Аянокоджи, таинственному студенту, ищущему наиболее мирный способ сосуществования со своими сверстниками, и его отношениям с ними, особенно с его соседкой по банку Сузуне Хорикитой.